南洋公學

1896年，盛宣懷因參與「洋務運動」認知到中國科技學術人才的匱乏，經多方努力後於上海創建南洋公學，以「保存國粹，講求實業」成為創校的宗旨，後更名為商部上海高等實業學堂、郵傳部上海高等實業學堂、南洋大學堂等。

上海工業專門學校

1912年中華民國成立後，劃歸繼承清政府郵傳部的中華民國交通部，更名為交通部上海工業專門學校。 此時的校徽是以上海工業專門學校為主體，校徽設計為圓型，外圈英文Government Institute of Technology‧SHAHGHAI,CHINA 為交通部上海工業專門學校的翻譯;校徽中間為盾牌，寫著拉丁文「DUCIT AMOR PATRIAE」，意為「對祖國的愛帶領著我」。

南洋大學

「上海工業專門學校、唐山工業專門學校、北平鐵路管理學校、北平郵電學校」四校，1921年將之合併，統稱交通大學，也是交通大學第一次合併，但不到一年即解體；上海工業專門學校獨立為交通大學上海學校，並在1922年~1927年更名為交通部南洋大學。1925年4月8日校慶時，南洋大學向師生和校友徵集校徽。同年底確定以當時在校生徐震池和楊恆的設計稿合而為一的樣式，並請土木工程學院副教授兼監理工程師楊培琒、機械工程學院副教授杜光祖加以修正。

交通大學

前述的交通部南洋大學，在1927年8月更名為交通部第一交通大學；1928年，滬、平、唐三校再次合併組成「交通大學」，此為交大二次合併。

自1928年開始，交大「東方MIT」的名聲日漸響亮，同時學校也更加注重文化建設，因此校徽中央刻上八字篆文校訓「 精勤、敦篤、果毅、忠恕」，而無鐵砧、鐵錘、鐵鍊、中西書籍與 1896 字 樣;其外圈環繞著一個充盈著滾珠的齒輪與承軸，其上刻有滾珠63粒、齒輪51齒(尖齒)，中西校名間無星號加以區隔，與後來校徽不同，但隨著校訓的改變，此版校徽使用時間亦不長。

交通大學

1940年代，又恢復了20年代原有的傳統校徽圖案，雖有細小差異，但圖案中的書籍、鐵砧、榔頭等均未變動。中英文校名分別為「交通大學」、「CHIAO TUNG UNIVRERSITY」，齒輪數為46齒。 自此，該圖案成為交大校徽的固定樣式，往後在學校的變遷和發展中未再出現根本性的改變。

國立交通大學

1949年中華民國政府遷臺，中華人民共和國政府的交大由上海市軍管會高教處接管，中華民國政府的交大校務則被迫中斷；1958年，交大正式在臺復校。

在臺復校初期，校徽樣式繁多，有22齒、60齒等不同版本，當時交大電子研究所所長李熙謀曾委託校友秦丕基統一樣式。秦丕基版本之校徽 (如上圖)，並無改去鐵砧、鐵鎚、鏈條及年份，惟齒論數訂為24齒，代表二十四小時，隱含著「日復一日，週而復始，自強不息」之意。

另一版，由校友吳伯楨與盧善棟設計校徽(如下圖)， 大致上與秦丕基的版本相同，惟中文書冊為八本，不同於秦丕基的六本，此版則用於交大復校初期之校旗。

國立陽明醫學院

由於台灣醫療資源不足，1968年國防部長蔣經國指示國防部、國軍軍醫、榮民總醫院籌備陽明醫學院。1975年陽明醫學院正式成立，招生醫學系學生120名，畢業醫學生，於教學醫院接受四年專科醫師訓練，之後至偏遠或醫療資源缺乏地區服務二年。

國立陽明大學

1994年7月1日，國立陽明醫學院改制為國立陽明大學，為中華民國第一所以醫學教育為主之國立大學。

校徽調整： 1.內外圓與文字色彩由金色調整為代表天空的藍色。 2.校名題字由具有醫師身份的孫文《民權初步》的字帖集字，取代原本楷體。

由於目前歷史上並沒有文本將長翅膀的飛蛇作為醫療象徵，推論當年的繪圖者是受軍醫體系的商神杖（雙蛇＋羽翼神杖）影響，將翅膀融入了正統象徵醫療的蛇杖（單蛇）上的蛇，展翅的形狀呈現字母Ｙ(Yang-Ming)的樣態，成為了現在的「飛蛇杖」。此飛蛇杖成為了極為獨特的陽明象徵。

國立交通大學

最終版的交大校徽出現的日期已不可考，據交大發展館提供的資料研判，大約是在2000年左右出現的版本，齒輪數訂定為60齒，則代表一甲子；而齒輪是運轉不息的，因此又寓含了「天行健，君子以自強不息」的意思。藍色也成為交大校徽主要的色彩，校旗則為藍底黃色。

此外，除台灣之外，另有上海交大、北京交大、西安交大、西南交大四校，除了西南以盾牌為主以外，上海、北京、西安三校之校徽皆源自1940年代之校徽，有著相同的設計。